21.2.1855 – Училище стало именоваться Николаевским – в память об императоре Николае I, скончавшемся 18.2.1855 г.
30.8.1855 – Офицерские классы отделены от Училища и названы Николаевской инженерной академией, которая вошла в состав Императорской ВА.
Воспитанники Училища (юнкера) и Академии (поручики и штабс-капитаны) и офицеры Главного инженерного управления вместе молились в Храме Архангела Михаила.
8.7.1857 – отдано Высочайшее повеление о создании в Инженерном замке отдельной однопрестольной церкви в двух комнатах бывших личных покоев Павла I. Используя средства генерал-инспектора по инженерной части (1852-59) вел. кн. Николая Николаевича (ст.), архитектор академик К.А. Ухтомский быстро произвел нужные работы.
12.1.1858 – протопресвитер В.Б. Бажанов, духовник Царствующего Дома и воспитатель Императора Александра II, в присутствии Императорской семьи произвел освящение Церкви Святых апостолов Петра и Павла.

Иконы в дубовом иконостасе написал академик П.М. Шамшин, запрестольный образ – Н.А. Лавров.
Храм на 250 человек, отделанный дубовыми панелями, находился в северо-западном углу замка, на втором этаже, а его алтарь стоял на месте кончины Павла I. На стенах висели мраморные черные доски с именами павших с честью воспитанников Николаевских ИА и ИУ. Во второй комнате находились притвор, ризница и церковная библиотека.
2.1858 – назначен первый настоятель церкви священник Л.И. Богдановский.
1861-88 – настоятелем служил протоиерей И.Г. Покровский.
29.4.1862 – в церкви венчался Д.И. Менделеев.
Во время ремонта в 1867 г. в церкви также были произведены небольшие внутренние переделки.
В 1869 г. церковь была расширена и перестроена. Тогда же в ней появились иконы святителя Николая и святого Александра Невского.
17.10.1869-10.9.1871 – диаконом церкви был А.В. Сыренский (впоследствии – архимандрит Алексий).
1876 – в храм перенесли исполненные П.П. Соколовым мраморные барельефы евангелистов, ранее украшавшие фасад.
На стене с 1883 г. помещался мраморный рельеф с изображением Александра II, сделанный по эскизу А.И. Тихобразова скульптором Н.А. Поповым. В этом храме любил уединенно молиться Александр II. В притворе в память об этом в 1883 г. был помещен мраморный рельеф работы М.П. Попова.
1888-98 – 10 лет настоятелем был протоиерей М.И. Середонин.
В 1893-94 гг. замок перестраивался архитектором Н.Л. Шевяковым.
1896 – в кабинете Николая I на втором этаже поместили образ святителя Николая.
Следует отметить, что некоторые выпускники Николаевского ИУ выбрали путь служения Богу: митрополит Пантелеимон, …
Преподаватель фортификации полковник Г.В. Бартошевич, ставший в эмиграции Старостой Крестовоздвиженского кафедрального собора (Швейцария), воспитал двух сыновей: Андрей (1910 – 1993) – архиепископ Антоний Женевский и Западно-Европейский (РПЦЗ); Лев (14.9.1914 – 18.8.1956) – епископ РПЦЗ Леонтий.
8.1918 – храм апостолов Петра и Павла был закрыт при протоиерее А.М. Темномерове.
Большая часть убранства храма сохранялась до 1937 г.
…
Замок сначала частично (1991), а потом полностью (1995) был передан Русскому музею. Замок охраняется государством как памятник архитектуры.

Настоятели:
2.1858-61 – Богдановский Л.И.
1861-88 – Покровский И.Г.
1888-98 – Середонин М.И.
…
1900-16 – Темномеров А.М.

Псаломщики:
12.3.1858-19.12.1868 – Скородумов Василий (? – 19.12.1868), псаломщик
17.10.1869-10.9.1871 – Сыренский А.В.
8.2.1872-1.10.1905 – Лебедев Павел Васильевич (? – 1.10.1905), диакон
13.10.1905-16 – Заварин Николай, диакон

Старосты:
14.3.1858-3.1869 – Иванов А.И., штабс-капитан
1869-77 – Гутков Ф.Ф., потомственный почетный гражданин
…
20.3.1897 – Данилевский Н.М.
…
2.9.1911 – Сокольский В.А.
16.6.1913-16 – Григораш И.М.

 

 
Брюховецкий Р.И.