В феврале 1921 г. Богдо-гэгэн издал указ о необходимости беспрекословного исполнения распоряжений Унгерна на территории Монголии. В этом указе говорилось: «Реставратор Монгольского государства, великий богатырский полководец, дар-хан цин-ван в степени хана – генерал барон Унгерн имеет выдающиеся заслуги в деле разгрома гаминов и восстановления нашего государства, искренне проявляя особые усилия. Поэтому правители местных уделов, чиновники и араты должны оказывать ему всеобщее уважение и немедленную помощь в деле мобилизации в армию и реквизиции скота для разгрома китайских милитаристов на разных участках границ Монголии, с честью выполняя приказы цин-вана барона Унгерна. За невнимательное отношение к его приказам и нарушение их виновные будут строго караться».

5-8.1921 – вторгся с войском на территорию России и потерпел поражение. После ряда неудач офицеры его бригады организовали против него заговор: обстреляли его, затем схватили и связали.
21.8.1921 – был выдан монголами партизанскому отряду П.Е. Щетинкина.
9.1921 – захвачен в плен отрядом РККА, после первых допросов отправлен в Новониколаевск и заключен в тюрьму.
«Унгерн был пленен отрядом монголов под командой Сун-дуй Гуна, куда он бежал от восставших против него казаков собственного отряда. Сначала Сун-дуй Гун намеревался передать Унгерна другим отрядам Азиатского корпуса, но налет красного отряда Щетинкина и Рокоссовского заставил выдать Унгерна Красной армии».
15.9.1921 – на показательном судебном процессе приговорен Сибирским ревтрибуналом к расстрелу, вечером того же дня приговор приведен в исполнение.
Президиум Новосибирского областного суда отказал в реабилитации (25.9.1998).