Награды: ордена: св. Станислава 3 ст. (1884), св. Анны 3 ст. (1889), св. Станислава 2 ст. (1892), св. Анны 2 ст. (1895), св. Владимира 4 ст. (1899), св. Владимира 3 ст. с мечами (4.8.1904), св. Георгия 4 ст. (20.9.1904), св. Георгия 3 ст. (24.10.1904).

 

Православный.

Родился в семье бедного дворянина украинского происхождения, отставного майора Исидора Денисовича и Марии Филипповны, урожденной Соколовой.  Младший сын в большой (10 детей) военной семье.

Окончил военную гимназию в Полоцке. Вступил в службу в Инженерное училище в Санкт-Петербурге.

1877 – окончил Николаевское ИУ. Выпущен прапорщиком (22.5.1877) в 1 Кавказский сапб. Подпоручик (2.9.1878).

1879-82 – окончил Николаевскую ИА по 1 разряду. Поручик (4.8.1881). Штабс-капитан (14.12.1881, за успехи в науках).

1881 – состоял в распоряжении начальника инженеров Кавказского ВО.

Переведён в военные инженеры и назначен в распоряжение начальника Чарохской инженерной дистанции.

1883 – прикомандирован к ГИУ.

1884 – принят сразу в старший класс Николаевской Академии ГШ. Капитан (4.1884).

1886 – окончил Николаевскую Академию ГШ по 1 разряду.

1886 – служил в Виленском ВО.

5.11.1886 – переведен в Генштаб и назначен старшим адъютантом 4АК.

26.1.1888 – штаб-офицер при Управлении начальника 6 местной бригады. Подполковник Генштаба (24.4.1888).

14.10.1891 – старший адъютант Штаба Виленского ВО. Полковник (5.4.1892, за отличие).

16.2.1893 – штаб-офицер для поручений при Штабе Виленского ВО.

25.11.1895 – НШ войск Уральской области.

18.12.1895 – командир 20сп.

В кампании против китайцев в (1900-01) находился в составе Десантного корпуса.

1901 – дежурный генерал Штаба Приамурского ВО. Генерал-майор (1901).

8.11.1903 – командир 7 Восточно-Сибирской сбр в Порт-Артуре, которая вскоре была развернута в дивизию.

1903 – начальник 7 Восточно-Сибирской сд.

Во время Русско-японской войны (1904-05) сумел усовершенствовать обороноспособность крепости. Современник отметил: "То, что не было сделано за семь лет. Кондратенко, насколько это было возможно, создал в несколько месяцев". Пользовавшийся исключительным авторитетом в войсках, за мужество и героизм награжденный высшими офицерскими наградами – орденами св. Георгия 4 ст. (20.9.1904) и 3 ст. (24.10.1904), Кондратенко успешно отразил 4 штурма противника. Генерал-лейтенант (22.10.1904).

Погиб (2.12.1904) во время артобстрела. Он был душою обороны Порт-Артура и с его смертью вопрос о судьбе крепости был решен.

«Через два дня, несмотря на продолжавшиеся бои, на похороны любимого командира собралась толпа солдат. Многие плакали.
– Без Исидорыча нам амба, – говорили в толпе. – Стессель продаст Артур ни за понюх табаку».

 

Жена Надежда Дмитриевна (3.11.1866 – 1927), урожденная Потопчина. Дети: Андрей (1893 – 7.7.1917); Николай (1894 – ?); Вера (27.3.1902 – ?); Мария (27.3.1902 – ?), в замужестве Кондратенко-Мирошникова.

Братья: Николай – военный топограф, полковник; Елисей (? – 27.12.1906) – правитель дел Кавказского отдела РГО (на 1896), действительный статский советник. 

 

Для увековечения памяти погибших защитников Порт-Артура и «в назидание юношеству – воспитанникам Николаевского Инженерного училища», по специальному высочайшему разрешению была открыта подписка между военными инженерами, офицерами инженерных войск для составления премиального фонда «Имени воспитанника Николаевского Инженерного училища и Николаевской Инженерной академии генерал-лейтенанта Кондратенко и военных инженеров, офицеров инженерных войск, защитников Порт-Артура» (проценты с капитала шли на ежегодную выдачу «Премии имени Кондратенко»).

25 Восточно-Сибирский сп переименован в 25 Сибирский генерал-лейтенанта Кондратенко полк.
1910 – Полоцкий КК переименован в Полоцкий генерала Кондратенко КК.