Украинец. Родился в пос. Знаменка (ныне – город Кировоградской области), в семье рабочего. Окончил 10 классов и школу ФЗУ. Работал в депо на ст. Знаменке. В рядах КА с 6.4.1933 г. Окончил командирские классы Военно-морского водолазного техникума в Балаклаве. Окончившим курс подготовки присваивалось звание водолазного специалиста. Краском. 1936 – окончил КУКС, вошедшие (1934) в состав Ленинградской ОКВИШ им. Коминтерна. … Член КПСС с 1939 г. Участник Советско-финляндской войны (1939-40). Участник Великой Отечественной войны. Воевал на Юго-Западном, Брянском и Воронежском (1942-43), 1 и 2 Украинских фронтах. В Действующей армии с 6.1941 г. Заместитель командира 392осапб по строевой части 232сд (38А, Воронежский фронт). Капитан. При прорыве обороны в районе Самотоевки вместе с передовыми отрядами саперов находился в боевых порядках и организовывал на месте работу подразделений. Обеспечивал продвижение дивизии, проводя инженерную разведку водных преград, ремонт и восстановление мостов и переходов. При наступлении дивизии (с 27.9.1943) находился на самом ответственном участке шоссе Чернигов – Киев (у г. Бровары). Под его руководством саперы сняли более 300 мин, большинство из которых были установлены в не извлекаемое положение. Командиром батальона представлен (29.9.1943) и награжден орденом Красной Звезды (пр. № 0106/н от 23.10.1943 г. 38А Воронежского фронта). Отличился при форсировании Днепра. Разведав переправу (3.10.1943) у с. Вышгород (ныне – город Киевской области), на 2 рыбацких лодках переправил саперное отделение на правый берег и занял с ним оборону, дав возможность высадиться передовым отрядам. В дальнейшем на 11 рыбацких лодках организовал переправу бойцов на плацдарм. Был ранен, но оставался в строю. Указом Президиума ВС СССР от 10.1.1944 г. капитану Петру Евдокимовичу Филоненко присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда» (№ 1966). Возможно, по вопросам секретности, даже в наградном листе не указан способ форсирования Днепра саперами, но есть и другая версия. «Подвиг русских ныряльщиков почти через 250 лет повторили их потомки. Когда советские войска освобождали от фашистских захватчиков Левобережную Украину, они с ходу решили форсировать Днепр. Однако выполнить этот замысел не удавалось. На правом берегу реки гитлеровцы создали мощный оборонительный рубеж. К Днепру невозможно было подойти, вода в реке кипела от разрывов бомб, мин и снарядов. И тогда было решено использовать отряд водолазов. Подобрали физически крепких и рослых, надели на них кислородные аппараты, хорошо вооружили и темной ночью отправили по дну реки на занятый неприятелем правый берег. Здесь им удалось без единого выстрела снять часовых, в рукопашной схватке перебить спящих в траншеях фашистских солдат и дать сигнал ударной армии. Так, с минимальными людскими потерями был форсирован Днепр на Лютежском направлении. Все водолазы были награждены орденами и медалями, а их командир Петр Евдокимович Филоненко удостоен звания Героя Советского Союза». Награжден орденом Отечественной войны 1 ст. (пр. № 37 от 29.4.1944 г.). Награжден медалью «За боевые заслуги» (3.11.1944). Командир 100исб 4инжбр. Майор. В критические моменты контратак противника под ураганным огнем лично руководил подготовкой переправы для 159УР при форсировании р. Тисы в районе Коморо (1.11.1944), р. Бодрог (приток Тисы) в районе с. Фельшеберецки (1.12.1944), что позволило атакующим овладеть (3.12.1944) крупным окружным центром Венгрии – Шаторалья-Уйхель. Батальон награжден орденом Красной Звезды (16.12.1944). Командиром бригады полковником А.М. Будариным представлен (25.12.1944) и награжден орденом Красного Знамени (пр. № 0221/н от 23.1.1945 г. 40А 2 Украинского фронта). После войны продолжал службу в армии. … 1953 – окончил КУОС. Подполковник. 1957 – уволен в запас. Жил и работал в г. Кишиневе. Умер и похоронен в Кишиневе.
